Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms