Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR3CQ9BUI4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms