Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms