Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA1CQ9BQE3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA1CQ9BQE3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA1CQ9BQE3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA1CQ9BQE3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA1CQ9BQE3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA1CQ9BQE3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA1CQ9BQE3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA1CQ9BQE3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA1CQ9BQE3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA1CQ9BQE3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TUBA1CQ9BQE3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
TUBA1CQ9BQE3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TUBA1CQ9BQE3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms