Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TM9SF2Q99805 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms