Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VAT1Q99536 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VAT1Q99536 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms