Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
C2orf48Q96LS8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
C2orf48Q96LS8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms