Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms