Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRG4Q92954 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms