Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM41Q8WV44 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms