Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AVL9Q8NBF6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms