Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTC29Q8NA56 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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TTC29Q8NA56 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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TTC29Q8NA56 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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