Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
GCSAMQ8N6F7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms