Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD35Q8N283 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD35Q8N283 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms