Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FRMD7Q6ZUT3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD7Q6ZUT3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD7Q6ZUT3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD7Q6ZUT3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD7Q6ZUT3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD7Q6ZUT3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD7Q6ZUT3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FRMD7Q6ZUT3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD7Q6ZUT3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD7Q6ZUT3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD7Q6ZUT3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FRMD7Q6ZUT3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms