Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ANKRD40Q6AI12 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms