Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRAMEF20Q5VT98 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRAMEF20Q5VT98 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms