Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C6orf141Q5SZD1 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C6orf141Q5SZD1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms