Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RPE65Q16518 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RPE65Q16518 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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RPE65Q16518 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RPE65Q16518 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPE65Q16518 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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