Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
E2F4Q16254 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms