Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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VAMP3Q15836 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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VAMP3Q15836 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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VAMP3Q15836 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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VAMP3Q15836 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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VAMP3Q15836 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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VAMP3Q15836 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VAMP3Q15836 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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