Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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PDCD1Q15116 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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PDCD1Q15116 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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PDCD1Q15116 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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PDCD1Q15116 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PDCD1Q15116 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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