Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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CLCA4Q14CN2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLCA4Q14CN2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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