Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSHL1Q14406 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms