Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAPSNQ13702 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAPSNQ13702 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms