Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CUL1Q13616 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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