Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LSAMPQ13449 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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LSAMPQ13449 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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LSAMPQ13449 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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LSAMPQ13449 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LSAMPQ13449 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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LSAMPQ13449 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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LSAMPQ13449 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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LSAMPQ13449 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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LSAMPQ13449 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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LSAMPQ13449 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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LSAMPQ13449 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LSAMPQ13449 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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