Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SGCGQ13326 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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