Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NFX1Q12986 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NFX1Q12986 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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