Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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