Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CAV1Q03135 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms