Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTUD4Q01804 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms