Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CSNK2BP67870 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CSNK2BP67870 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2BP67870 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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