Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK-24P63145 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms