Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CACNA2D1P54289 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms