Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
COPAP53621 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPAP53621 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPAP53621 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPAP53621 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPAP53621 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPAP53621 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPAP53621 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPAP53621 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPAP53621 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPAP53621 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPAP53621 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COPAP53621 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPAP53621 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPAP53621 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms