Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDF5P43026 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GDF5P43026 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GDF5P43026 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms