Protein–RNA interactions for Protein: P40197

GP5, Platelet glycoprotein V, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP5P40197 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP5P40197 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP5P40197 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP5P40197 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP5P40197 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GP5P40197 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GP5P40197 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GP5P40197 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GP5P40197 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GP5P40197 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms