Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TGFBR1P36897 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms