Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ARL3P36405 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ARL3P36405 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ARL3P36405 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms