Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HOXD13P35453 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms