Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC8A1P32418 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms