Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASQ1P31415 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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CASQ1P31415 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CASQ1P31415 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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