Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 LINC02139-201ENST00000612023 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VAMP1P23763 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms