Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms