Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CXCL3P19876 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CXCL3P19876 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CXCL3P19876 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CXCL3P19876 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CXCL3P19876 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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