Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms