Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ITGAVP06756 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms