Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VTNP04004 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VTNP04004 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VTNP04004 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms