Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EEF1E1O43324 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EEF1E1O43324 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms